指导全系统稽查工作；受理药品、医疗器械质量和假劣药品案件的投诉、举报；负责查处药品、医疗器械生产、经营、使用中的违法违规行为；协调跨地区及重大案件的查处；组织实施全省药品、医疗器械抽检工作，发布质量公告。
